五合站位于康城市五合区，是一等站。站场规模为3台10线。

站台包含3个岛式站台，没有侧式站台，铁路线包含6条到发线和4条越行线。

五合站整体位于地下，地上则是康城五合国际机场航站楼。

五合站可换乘5号线、10号线、12号线、16号线、18号线、19号线、20号线、28号线、五合机场线共9条轨道交通线路。

注：10号线与12号线共用1个岛式站台，两站皆为终点站，站前折返。